1998 m. Užtvankos katedros tyrimo metu senovės struktūros liekanos nebuvo atnaujintos. Pietrytinė Užtvankos katedros dalis yra labiausiai išsaugota, o Johno teologo bažnyčia beveik nepaliesta, taip pat iš dalies išsaugotos pietinės, centrinės ir šiaurinės apses. Katedros sienos, stulpai, grindų liekanos, paveikslai išliko nedideliuose fragmentuose. Bendra senovės struktūros liekanų būklė buvo kritinė. Kadangi beveik visas likusių liekanų paviršius buvo atvirame ore ir neturėjo tinkamos apsaugos, tai sukėlė didelę žalą mūro paviršiui. Gipso sluoksniai daugumoje konservuotų sienų patyrė nuostolius nuo 20 iki 90-100% gipso ploto, eksponuojami mūro darbai buvo stiprūs: paviršiaus sunaikinimo gylis siekė 2–2,5 cm, o mūro siūlės buvo krekinguotos, mūro skiedinys buvo iš dalies prarastas. Daugelyje senovės struktūros (apses, kai kurių sienų) likučių buvo didelių mūrinės medžiagos nuostolių – grindjuostės, akmuo, skiedinys, o nuostolių gylis buvo iki 30-40 cm, dažnai senosios mūro liekanose buvo įtrūkimų (pvz. pietinėje sienelėje buvo atidarymo plotis iki 5 cm, taip pat pastebėta, kad pietinėje apse Šv.

Taip pat buvo užfiksuota senovės sluoksnio tinki, įtrūkimai beveik visur perpjauti, pofarbuvan sluoksniai, senas tinkas turėjo daug prarastų dalių, žetonų. Atskiras sienų dalis su dideliu drėgnumu (drėgnas iš kritulių, drėgmės siurbimas iš dirvožemio) buvo paveiktas bioplastizavimu, užfiksuotas žiedas.

Griuvėsiai buvo dažyti cinkuotu plienu, kai kuriose vietose plienas buvo ėsdinantis, o kai kurios raidės buvo visiškai prarastos. Metalinės atraminės sijos buvo nudažytos ir korozijos.