На момент обследования 1998 года Успенского собора остатки древней кладки не были расконсервированы. Больше всего сохранилась юго-восточная часть Успенского собора с почти неповрежденной церковью Иоанна Богослова, а также частично сохранившимися южной, центральной и северной апсидами. Небольшими фрагментами сохранились стены собора, столбы, остатки пола, росписи. Общее состояние остатков древней кладки было аварийным. Поскольку почти вся поверхность сохранившихся остатков находилась под открытым небом и не имела надлежащей консервационной защиты, это привело к значительной порче поверхности кладки. Штукатурные слои на большинстве сохранившихся стен имели потери от 20 до 90-100% площади штукатурки, обнаженная кладка подверглась сильному выветриванию: глубина поверхностной деструкции достигала 2-2,5 см, при этом швы кладки растрескались, кладочный раствор был частично утрачен. На многих участках остатков древней кладки (апсиды, некоторые стены) существовали значительные потери кладочного материала – плинфы, камня, раствора, причем глубина потерь составляла до 30-40 см. Часто в остатках старой кладки наблюдались трещины, некоторые из них (например, в южной стене) имели ширину раскрытия до 5 см. Трещина наблюдалась также и на примыкании Иоанно-Богословского придела к южной апсиде.

Также было зафиксировано повреждение древнего штукатурного слоя, почти везде его пронизывали трещины, слои окраски шелушились, древняя лепнина имела много утраченных деталей, сколов. Отдельные участки стен с повышенной влажностью (замокание от атмосферных осадков, подсос влаги из почвы) были поражены биообрастаниями, на кладке фиксировались высолы.

Руины имели покрытие из оцинкованной стали с окраской, местами сталь имела коррозию, а некоторые листы были вообще утрачены. Металлические опорные балки были неокрашенными и имели поверхностную коррозию.