В акте обследования церкви Иоанна Предтечи от 1893 года обозначают: «Первоначально в виде квадратной палаты, алтарь отделялся тремя арками. С южной стороны на всю длину церкви был промежуток между Предтеченской и Успенской церквушкой шириною в 2 аршина 12 вершков. С южной части был древний ход на второй этаж. Теперь ход замурован, а промежуток используется как кладовая. На первом этаже своды коробовые, над окнами стрельчатые. На втором этаже коробовые своды, над апсидами полукотловые. Над средней и южной частью отверстия для сквозного фонаря на четырех «пазухах» – парусах, с котельным сводом, опирающимся на 2 столба и 2 стены. Под фонарем шиферный карниз. В промежутке (с южной стороны) полукоробовый свод с продольной «пазухой» Из этого помещения есть древний выход на хоры над «Трапезой» и на крышу. На первом этаже в полу диаконника (с южной стороны) ныне закрытое отверстие для спуска в нижний подвальный этаж. В средней апсиде пробита дверь в Стефановский придел, в южной стене есть дверь в кладовую…
На стенах лепнины нет, крещатые столбы гладкие без карнизов».
3 акта одна тысяча восемьсот девяносто три года с участием В. Николасва видно, что комиссия: «…осмотрела на хорах стены Иоанно-Предтеченской церкви – Церковь эта сохранилась в совершенно древнем своем виде… Единственная переделка – пробиты проходы в апсидах… В западной, южной и северной стенах обнаружились окна и соответствующие им впадины, заложенные перевязанным проволокой кирпичом… Проходы, сделанные в апсидах, лишены арок или перемычек, поэтому кладка над ними вываливается… Комиссия пришла к выводу, что после ремонта и освобождения от закладки окон и ниш, нужно заделать проходы с восточной стороны… Верх апсид Предтеченской церкви, видных из Преображенского придела, заканчивается полуциркульным сводом. Над средним проходом видны «три полуциркульные впадины в виде окон»
Как писал историк К. Шероцкий, «в XVII в. этот храм был разбит на два этажа, и верхняя его часть присоединена к хорам большой церкви».
«В северо-западном пристрое всю старинную церковь Предтечи занимает один алтарь; в нем 4 столба (не крестообразные) и три апсидки, почти совсем не участвуют из толщи восточной стены; но они разделены полуколонками, которые можно видеть со стороны бокового алтаря св. Архидам. Стефана; из хора большой церкви сюда ведет древняя дверь; в восточной стене в верхних частях апсиды пробиты входы в придел Преображения; снизу вела сюда лестница, ныне находящаяся под полом; на западной и южной стенах видны забитые окна; в парусах – глашатаи…».
«Иоанно-Предтеченская церковь а нижний подвальный этаж стройный ниже площадки нынешнего уровня, и остается до сего времени ничем незанятым, и не оштукатуренным, со времени древнего своего устройства…».
Жертвенник кирпичный, устроен в особом северном предолтарии, часть его помещается в полукруге стен на первоначальном месте, высотою и шириною 1 арш. 4 верш. «.
«Церковь Иоанна Предтечи вся расписана живописным письмом в первой половине XIX века, изображениями, относящимися к жизни Св. Иоанна Крестителя» Кроме натурных исследований памятника, проводились и ее архивные исследования. В 1982, 1984-1986 и 1997-1998 годах были подготовлены основательные исторические записки об Успенском соборе, которые были учтены и использованы при выполнении последнего, уточненного варианта проекта воссоздания храма с реконструкцией Иоанно-Предтеченской церкви, предложенной М.В. Холостенко.
